Exportar este item: EndNote BibTex

Use este identificador para citar ou linkar para este item: http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/7832
Tipo do documento: Dissertação
Título: Avaliação de iniciadores específicos para detecção de grupos de anastomose de Rhizoctonia solani
Autor: AMÂNCIO, Lucas Correia Santana 
Primeiro orientador: MICHEREFF, Sami Jorge
Primeiro coorientador: CORREIA, Kamila Câmara
Segundo coorientador: MACHADO, Alexandre Reis
Primeiro membro da banca: MICHEREFF, Sami Jorge
Segundo membro da banca: SANTOS, Alice Maria Gonçalves
Terceiro membro da banca: LARANJEIRA, Delson
Resumo: O gênero Rhizoctonia é formado por grupos de indivíduos relacionados, mas geneticamente distintos agrupados com base em características moleculares e um método clássico de compatibilidade vegetativa, denominados grupos de anastomose (AGs). Nesse contexto, vários iniciadores específicos baseados na região do espaçador interno transcrito (ITS) já foram desenvolvidos para discriminar AGs e seus subgrupos no complexo de espécies de Rhizoctonia, mas inexistem estudos da eficácia desses iniciadores considerando um grande número de AGs conhecidos. Portanto, o objetivo deste trabalho, foi avaliar a eficácia de iniciadores específicos para detecção dos quatro predominantes AGs de Rhizoctonia solani predominantes em nível mundial (AG-1 IA, AG-1 IB, AG-2-1, AG-3 PT, AG-3 TB, AG-4 HGI e AG-4 HGII). Inicialmente o DNA genômico de treze isolados de R. solani e sete de Rhizoctonia binucleado pertencentes a diferentes AGs foram extraídos e quantificados. A região ITS do DNA ribossômico destes isolados foi sequenciada utilizando iniciadores universais (ITS1 e ITS4) para confirmar a identicidade dos AGs. As relações filogenéticas foram analisadas pelo método de máxima verossimilhança individualmente. Os isolados de R. solani e Rhizoctonia binucleada juntamente com espécies fúngicas não relacionadas utilizadas como controle negativo (Fusarium oxysporum, Macrophomina phaseolina e Sclerotium rolfsii) foram testados simultaneamente com cada conjunto de iniciadores descrito acima. A identidade de todos os AGs de R. solani e Rhizoctonia binucleadas foram confirmados através de análises filogenéticas das sequências da região ITS. Os resultados das análises de PCR mostraram que todos os conjuntos de iniciadores amplificaram outros AGs sob as condições indicadas e muitos destes iniciadores produziram amplificações para espécies fúngicas não relacionadas com R. solani. Concluímos que o exclusivo uso destes iniciadores não é indicado para detecção de AGs, visto a grande diversidade intra e interespecífica das espécies de Rhizoctonia. Portanto é de grande importância o desenvolvimento de novos iniciadores baseado em regiões gênicas mais variáveis considerando o número de AGs atualmente conhecidos.
Abstract: The genus Rhizoctonia is composed of groups of related but genetically distinct individuals grouped on the basis of molecular characteristics and a classical method of vegetative compatibility, called anastomosis groups (AGs). In this context, several specific primers based on the transcribed internal spacer (ITS) region have already been developed to discriminate AGs and their subgroups in the Rhizoctonia species complex, but there are no studies of the efficacy of these primers considering a large number of known AGs. Therefore, the objective of this work was to evaluate the efficacy of specific primers for the detection of the four predominant Rhizoctonia solani AGs worldwide (AG-1 IA, AG-1 IB, AG-2-1, AG-3 PT, AG-3 TB, AG-4 HGI e AG-4 HGII). Initially the genomic DNA of thirteen isolates of R. solani and seven of binucleated Rhizoctonia belonging to different AGs were extracted and quantified. The ITS region of the ribosomal DNA of these isolates was sequenced using universal primers (ITS1 and ITS4) to confirm the identity of the AGs. Phylogenetic relationships were analyzed by the maximum likelihood method individually. The isolates of R. solani and binucleate Rhizoctonia together with unrelated fungal species used as negative control (Fusarium oxysporum, Macrophomina phaseolina and Sclerotium rolfsii) were tested simultaneously with each set of primers described above. The identity of all AGs from R. solani and binucleated Rhizoctonia were confirmed by phylogenetic analysis of the sequences ITS region. The results of the PCR analyzes showed that all primer sets used amplified other AGs under the conditions indicated and most these primers produced amplifications for unrelated fungal species with R. solani. We conclude that the exclusive use of these primers is not indicated for the detection of AGs, since the great intra and interspecific diversity of Rhizoctonia species. Therefore, is very important to develop new specific primers based in gene regions more variables for AGs detection considering the number of AGs currently known.
Palavras-chave: Rhizoctonia solani
Grupos de anastomose
Detecção molecular
Área(s) do CNPq: FITOSSANIDADE::FITOPATOLOGIA
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Universidade Federal Rural de Pernambuco
Sigla da instituição: UFRPE
Departamento: Departamento de Agronomia
Programa: Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia
Citação: AMÂNCIO, Lucas Correia Santana. Avaliação de iniciadores específicos para detecção de grupos de anastomose de Rhizoctonia solani. 2018. 62 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
URI: http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/7832
Data de defesa: 31-Jul-2018
Aparece nas coleções:Mestrado em Fitopatologia

Arquivos associados a este item:
Arquivo Descrição TamanhoFormato 
Lucas Correia Santana Amancio.pdfDocumento principal2,94 MBAdobe PDFBaixar/Abrir Pré-Visualizar


Os itens no repositório estão protegidos por copyright, com todos os direitos reservados, salvo quando é indicado o contrário.