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Tipo do documento: Tese
Título: Caracterização de um isolado de Yam mild mosaic virus (YMMV) obtido de Dioscorea trifida, sequenciamento do genoma e produção de antissoro policlonal
Autor: RABELO FILHO, Francisco de Assis Câmara 
Primeiro orientador: RIBEIRO, Gilvan Pio
Primeiro coorientador: RIBEIRO, Bergmann Morais
Segundo coorientador: NAGATA, Tatsuya
Primeiro membro da banca: LIMA, José Albérsio de Araújo
Segundo membro da banca: ANDRADE, Genira Pereira de
Terceiro membro da banca: NICOLINE, Cícero
Resumo: O inhame (Dioscorea spp.) apresenta importante papel socioeconômico na região Nordeste do Brasil. Além de fornecer alimento de alto valor nutritivo para a dieta humana, é fonte de renda para famílias de baixo poder aquisitivo, empregando grande contingente de mão de obra. Dentre os problemas fitossanitários desta cultura, destacam-se as doenças fúngicas e aquelas causadas por nematoides. As viroses apresentam também elevada importância, principalmente por ocasionarem degenerescência de cultivares, com diminuição do vigor das plantas e, consequentemente perdas qualitativas e quantitativas da produção. Três vírus se destacam, em nível de Brasil, com registros nas principais cultivares empregadas no Nordeste, Yam mosaic virus (YMV) e Yam mild mosaic virus (YMMV), pertencentes ao gênero Potyvirus, família Potyviridae e um vírus do gênero Badnavirus, família Caulimoviridae. Recentemente, foram detectados mais dois vírus, pertencentes aos gêneros Begomovirus e Curtovirus, família Geminiviridae. No presente trabalho, inicialmente foram efetuadas a detecção e caracterização de um isolado de YMMV, obtido de D. trifida, por meio de análise eletromicroscópica, incluindo a visualização de inclusões citoplasmáticas típicas do gênero Potyvirus. Em seguida, foram realizados estudos moleculares com primers específicos para o YMMV em RT–PCR, seguido de RT–PCR com primers degenerados para vírus do gênero Potyvirus, clonagem do produto correspondente à capa proteica e análise filogenética, com os dados de sequências disponíveis no GenBank. Também foi realizado o sequenciamento do genoma completo de um isolado de YMMV e estudo detalhado da sequência de nucleotídeo, mediante amplificação do cDNA e clonagem em plasmídeos pGEM-T Easy e do pCR 4 Topo, cujos dados foram depositados no GenBank. A diagnose das fitoviroses pode ser efetuada por técnicas sorológicas e moleculares. Na cultura do inhame, usa-se, em geral, ferramentas moleculares, pela dificuldade na aquisição de antissoros específicos, o que encarece a identificação dos agentes virais. Antissoro policlonal para YMMV foi desenvolvido em coelho usando a proteína capsidial de um isolado do vírus expressa in vitro no sistema Escherichia coli.
Abstract: The yam (Dioscorea spp.) has an important economic and social role in the Northeast of Brazil, providing food with high value to the human diet. It is also a source of income to poor family, employing large number of manpower. Among the phytosanitary problems of this crop, the fungal and nematode diseases are the most important ones. The virus diseases also have high importance, especially for causing cultivar degeneracy, with reduction of plant vigor and consequent qualitative and quantitative production losses. Three viruses stand out in Brazil with occurrence on main cultivars used in Northeast, Yam mosaic virus (YMV) and Yam mild mosaic virus (YMMV), belonging to the genus Potyvirus, family Potyviridae and one virus of the genus Badnavirus, family Caulimoviridae. Recently, two more viruses from the genus Begomovirus and Curtovirus genus, family Geminiviridae were detected. In the present work, initially, the detection and characterization of an YMMV isolate obtained from D. trifida were undertaken by electronic microscope analysis including visualization of cytoplasmatic inclusions typical of the genus Potyvirus. In addition, molecular studies with specific primers for YMMV in RT–PCR, followed by RT–PCR with degenerate primers to viruses of the Potyvirus genus, cloning the product corresponding to the coat protein and phylogenetic analysis including sequences available at the GenBank were done. Sequencing of the complete genome of a YMMV isolate and a detailed study on the nucleotide sequence of this virus by cDNA amplification and cloning in plasmids pGEM-T Easy and the pCR 4 Topo were also realized, and the data deposited in GenBank. The diagnosis of plant virus diseases can be realized by serological and molecular techniques. In yam crop, molecular tools normally are used due to difficulties in acquiring specific antisera, making more expense the identification of viral agents. Polyclonal antiserum was produced in rabbit for YMMV, using the coat protein of an isolate of YMMV expressed in vitro using Escherichia coli system.
Palavras-chave: Potyvirus
Inhame
Clonagem
Diagnose
Yam
Cloning
Diagnosis
Área(s) do CNPq: FITOSSANIDADE::FITOPATOLOGIA
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Universidade Federal Rural de Pernambuco
Sigla da instituição: UFRPE
Departamento: Departamento de Agronomia
Programa: Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia
Citação: RABELO FILHO, Francisco de Assis Câmara. Caracterização de um isolado de Yam mild mosaic virus (YMMV) obtido de Dioscorea trifida, sequenciamento do genoma e produção de antissoro policlonal. 2013. 73 f. Tese (Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
URI: http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6595
Data de defesa: 28-Feb-2013
Appears in Collections:Doutorado em Fitopatologia

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