Análises biológicas, sorológicas e moleculares de plantas de amendoim infectadas por vírus obtidas em áreas produtoras de São Paulo

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Tipo do documento:	Dissertação
Título:	Análises biológicas, sorológicas e moleculares de plantas de amendoim infectadas por vírus obtidas em áreas produtoras de São Paulo
Autor:	PANTOJA, Michelle Barros
Primeiro orientador:	RIBEIRO, Gilvan Pio
Primeiro coorientador:	CARVALHO, Rita de Cássia Pereira de
Segundo coorientador:	ANDRADE, Genira Pereira de
Primeiro membro da banca:	MARANHÃO, Sandra Roberta Vaz Lira
Segundo membro da banca:	ASSIS FILHO, Francisco Miguel de
Resumo:	O amendoim (Arachis hypogaeae L.) é uma oleaginosa pertencente à família Fabaceae, originária da América do Sul. Seus grãos são muito utilizados como fonte de alimento e na produção de óleo. Os principais países produtores são China, Índia e Estados Unidos, que ocupam o 1°, 2° e 3º lugar, respectivamente. O Brasil situa-se na 17ª posição, tendo o Estado de São Paulo contribuído com 95% da produção total do país. O amendoim é hospedeiro de um grande número de espécies de vírus, que limitam o desenvolvimento da cultura em diferentes partes do mundo. O objetivo deste trabalho foi detectar a presença de vírus em plantas de amendoim oriundas de 10 municípios paulistas, sendo analisadas amostras (am) de campos (cam) de Santa Adélia (3cam/6am), Lusitânia (1cam/1am), Jaboticabal (3cam/6am), Itápolis e Pindorama (1cam/2am, cada), Tupã (4cam/8am), Rancharia e Marília (1cam/2am, cada), Guaimbê (2cam/4am) e Guarantã (1cam/2am). Plantas de amendoim foram usadas para manutenção dos isolados virais, empregando-se transmissão sucessivas por meio de enxertias. Os isolados foram submetidos a análises biológicas em gama de hospedeiros, sorológicas pelo método Dot-ELISA e moleculares por RT-PCR e metagenômica. Os hospedeiros indicadores testado foram: Lactuca sativa, Capisicum annuum, C. annuum var. 679, C. annuum var. Ikeda, Chenopodium amaranticolor, C. quinoa, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiniana tabacum, N. benthamiana, N. rustica, N. glutinosa, Physalis floridana e Solanum sculentum. Com base nos resultados do teste Dot-ELISA foi detectada a presença dos tospovírus Groundnut ringspot virus (GRSV) (16am), Tomato chlorotic spot virus (TCSV) (6am) e do Tomato spotted wilt virus (TSWV) (3am). Ao ser comparado os resultados obtidos no sequenciamento (Macrogen) do fragmento obtido no teste RT-PCR, com as sequências disponíveis no GenBank, ficou comprovada ocorrência do GRSV. Por outro lado, a análise metagenômica confirmou a presença do GRSV e detectou o potyvírus Peanut motlle virus PeMoV), ambos com genoma completo.
Abstract:	The peanut (Arachis hypogaea) is an oleaginous plant belonging to the Fabaceae family, native to South America. Its kernels are widely used as a food source and the production of oil. The main producing countries are China, India and the United States, which occupy the 1st, 2nd and 3rd places, respectively, in the ranking of world production. Brazil occupies the 17th position, in which the State of São Paulo stands out with 95% of total production of the country. The peanut is infected by several virus species, which limit the development of the crop in different parts of the world. The objective of this study was to detect the presence of virus in peanut plants in 10 counties of the State of São Paulo. Thirty-five samples (s) from 18 fields (f) were analyzed from Santa Adélia (3f/6s), Lusitânia (1f/1s), Jaboticabal (3f/6s), Itápolis e Pindorama (1f/2s, each), Tupã (4f/8s), Rancharia e Marília (1f/2s, each), Guaimbê (2f/4s) and Guarantã (1f/2s). The maintenance of the virus isolates was done in peanut plants graft inoculated. The isolates were submitted to biological, serological e molecular analyses. For host range study, Lactuca sativa, Capisicum annuum, C. annuum var. 679, C. annuum var. Ikeda, Chenopodium amaranticolor, C. quinoa, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiniana tabacum, N. benthamiana, N. rustica, N. glutinosa, Physalis floridana and Solanum sculentum were mechanically inoculated and the symptoms analyzed. Based on Dot-ELISA results, the presence of the tospoviruses Groundnut ringspot virus (GRSV) (16s), Tomato chlorotic spot virus (TCSV) (6s) and do Tomato spotted wilt virus (TSWV) (3s) was detected. The comparison of the sequence obtained in the RT-PCR test with those deposited in the GenBank, revealed the occurrence of the GRSV. Furthermore, the metagenomic analysis showed the presence of the GRSV, as well as, the potyvirus Peanut motlle virus (PeMoV), both with complete genome.
Palavras-chave:	Amendoim Vírus Análise metagenômica Arachis hypogaea L. Peanut Metagenomic analysis
Área(s) do CNPq:	FITOSSANIDADE::FITOPATOLOGIA
Idioma:	por
País:	Brasil
Instituição:	Universidade Federal Rural de Pernambuco
Sigla da instituição:	UFRPE
Departamento:	Departamento de Agronomia
Programa:	Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia
Citação:	PANTOJA, Michelle Barros. Análises biológicas, sorológicas e moleculares de plantas de amendoim infectadas por vírus obtidas em áreas produtoras de São Paulo. 2015. 49 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
Tipo de acesso:	Acesso Aberto
URI:	http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6002
Data de defesa:	26-Feb-2015
Appears in Collections:	Mestrado em Fitopatologia

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