1. TEDE2
  2. UFRPE. Sede Campus de Dois Irmãos em Recife
  3. PPG em Biometria e Estatística Aplicada
  4. Mestrado em Biometria e Estatística Aplicada
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dc.creatorIDALINO, Rita de Cássia de Lima-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/1907064683657020por
dc.contributor.advisor1SANTORO, Kleber Régis-
dc.contributor.referee1GOMES FILHO, Manoel Adrião-
dc.contributor.referee2STOSIC, Tatijana-
dc.contributor.referee3FERREIRA, Tiago Alessandro Espíndola-
dc.date.accessioned2016-08-10T13:59:35Z-
dc.date.issued2010-12-20-
dc.identifier.citationIDALINO, Rita de Cássia de Lima. Homologias em genes relacionados à resistência à mastite em vacas, ovelhas e cabras. 2010. 81 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Biometria e Estatística Aplicada) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.por
dc.identifier.urihttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/5258-
dc.description.resumoDiante da grande massa de dados que é gerada na área da genética molecular, é de suma importância que técnicas que possibilitem a organização e interpretação desses dados sejam desenvolvidas e amplamente divulgadas. Inicialmente, neste trabalho, foi realizada uma análise da composição de três sequências genéticas, das espécies Bovina (Bos taurus), Caprina (Capra hircus) e Ovina (Ovis aries), em seguida aplicamos técnicas de alinhamentos para identificação de similaridades entre estas. Posteriormente, utilizamos a teoria das cadeias de Markov com estados ocultos, HMM’s (Hidden Markov Models), na aplicação do problema de discriminação de regiões homogêneas em sequências de DNA. Utilizamos o algoritmo de Viterbi como uma ferramenta auxiliar para obtenção de regiões homogêneas e em seguida o algoritmo Baum-Welch para maximizar as probabilidades de uma sequência de observações. Foram analisados trechos dos genes HSP70.1 e NRAMP-1 para três espécies diferentes.por
dc.description.abstractGiven the large amount of data that is generated in the field of molecular genetics, is of paramount importance that techniques which allow the organization and interpretation of such data be developed and widely disseminated. Initially, we carried out a composition analysis of three gene sequences of the species: ox (Bos taurus), goat (Capra hircus), and sheep (Ovis aries), then we applied alignment techniques for identification of similarities between them. Subsequently, we used the Markov Chain theory with hidden states, i.e. Hidden Markov Models (HMMs, hereafter), in the application of discrimination problem of homogeneous regions in DNA sequences. We used the Viterbi algorithm as an auxiliary tool to obtain homogeneous regions, and then the Baum-Eelch algorithm in order to maximize the probability of a sequence of observations. We analyzed portions of HSP70.1 and NRAMP-1 genes for three different species.eng
dc.description.provenanceSubmitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-08-10T13:59:35Z No. of bitstreams: 1 Rita de Cassia de Lima Idalino.pdf: 2600123 bytes, checksum: 41f878b68e3437742821d874a6955502 (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2016-08-10T13:59:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rita de Cassia de Lima Idalino.pdf: 2600123 bytes, checksum: 41f878b68e3437742821d874a6955502 (MD5) Previous issue date: 2010-12-20eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal Rural de Pernambucopor
dc.publisher.departmentDepartamento de Estatística e Informáticapor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.initialsUFRPEpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Biometria e Estatística Aplicadapor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectSequências genéticaspor
dc.subjectHomogeneidadepor
dc.subjectModelos ocultos de Markovpor
dc.subjectGene sequenceseng
dc.subjectHomogeneityeng
dc.subjectHidden Markov Modelseng
dc.subject.cnpqCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::PROBABILIDADE E ESTATISTICApor
dc.titleHomologias em genes relacionados à resistência à mastite em vacas, ovelhas e cabraspor
dc.typeDissertaçãopor
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