@MASTERSTHESIS{ 2019:234847375, title = {Caracterização estrutural, funcional e diversidade de osmoprotetores no transcriptoma de Stylosanthes scabra (Vogel) sob déficit hídrico}, year = {2019}, url = "http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/9507", abstract = "Estresses abióticos, como o déficit hídrico, prejudicam o desenvolvimento das plantas causando mudanças morfológicas, fisiológicas, bioquímicas e moleculares, alterando a expressão de genes que ativam respostas bioquímicas e fisiológicas, como por exemplo, o acúmulo de solutos compatíveis. Os osmoprotetores são moléculas altamente solúveis que atuam principalmente no ajuste osmótico celular mantendo a sua turgidez (volume celular) mesmo com o potencial hídrico baixo. Abordagens moleculares e computacionais têm possibilitado novas perspectivas sobre a estrutura e função de proteínas e genes já conhecidos e se mostrado eficientes em estudos com espécies de genoma conhecido, no entanto, poucos estudos têm sido conduzidos com espécies nativas. Stylosanthes scabra, leguminosa com alto potencial forrageiro, é nativa do semi-árido brasileiro e apresenta tolerância à seca. O presente projeto teve como objetivo identificar e caracterizar transcritos candidatos pertencentes a diferentes classes de osmoprotetores no transcriptoma de S. scabra sob déficit hídrico. Inicialmente, sequências candidatas para genes osmoprotetores foram obtidas no banco de dados de S. scabra, procedendo-se com a anotação dos dados, tradução e identificação dos domínios conservados por meio de ferramentas in silico. Um total de 74 sequências de osmoprotetores com domínios conservados foram identificadas em S. scabra, sendo 40 de Trealose (TPS e TPP), 17 de Mio inositol (MIPS e IMP), 10 de Glicina betaína (BADH e CMO) e 7 de Prolina (P5CS e P5CR) resultados equivalentes ao descrito em outras espécies vegetais. Estes foram ancorados no genoma de Arachis duranensis (n=10) revelando um total de 19 loci ancorados similar ao encontrado em soja, outra espécie do gênero Fabaceae. Árvores fenéticas de ortólogos de genes de osmoprotetores demonstraram o agrupamento das sequências de S. scabra com outras espécies da família Fabaceae, comprovando sua similaridade e apontando uma conservação destas proteínas. A análise de expressão gênica diferencial in silico foi realizada utilizando dados de RNA-Seq onde dos 74 transcritos 35 mostraram-se diferencialmente expressos, apresentando indução e repressão em ambos os tempos de 6 h e 24 h de estresse indicando que estes participam da resposta do vegetal ao déficit hídrico. Esses resultados mostram-se valiosos para o melhoramento genético da espécie S. scabra e de outras leguminosas de importância agrícola.", publisher = {Universidade Federal Rural de Pernambuco}, scholl = {Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas}, note = {Departamento de Agronomia} }