@MASTERSTHESIS{ 2011:64770132, title = {Construção de uma biblioteca genômica de DNA para o camarão pitu Macrobrachium carcinus (Linnaeus, 1758), enriquecida para microssatélite}, year = {2011}, url = "http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6392", abstract = "O camarão de água doce pitu (Macrobrachium carcinus ocorre desde o estado da Flórida (EUA) até a região Sul do Brasil. A espécie está inserida na lista vermelha de espécies ameaçadas de extinção do Ministério do Meio Ambiente. Programas de repovoamento constituem uma prática comum na recuperação de estoques, especialmente em águas continentais. Esses programas precisam atender a certos princípios, para assegurar que a diversidade genética seja preservada. O conhecimento da diversidade e estrutura genéticas de populações selvagens é uma informação essencial para subsidiar atividades de repovoamento. Marcadores moleculares de microssatélite são freqüentemente usados para descrever a estrutura genética por serem altamente polimórficos, codominantes e seletivamente neutros. DNA total do camarão pitu foi extraído, digerido com a enzima RsaI, purificado, desfosforilado, ligado a adaptadores e amplificados via reação em cadeia da polimerase (PCR). A hibridização foi feita com sondas biotiniladas para motivos tetranucleotídicos, tais como (GACA)4 e (GATA)7 e um mix de trinucleotídeos, (ATT)8, (CTT)8, (GGT)8. O DNA foi então ligado a um vetor de clonagem e transformado em células competentes de Escherichia coli. Um total de 358 clones foi gerado, dentre os quais 237 foram positivos, sendo 121 deles sequenciados. Repetições do tipo di(32), tri(7) e tetra(27) núcleotídicas foram obtidas, a partir dos quais primers foram construídos, usando o programa Primer3. Dentre os marcadores otimizados para amplificação, seis apresentaram-se monomórficos e 26 polimórficos. A maior parte das repetições foi do tipo (GA) n=14 e (TC) n=10, seguidas de motivos tetra, (GACA) n=8, (TCGT) n=8 e (CTGT) n=7. O alto número de repetições tetranucleotídicas é extremamente vantajoso por facilitar o processo de discriminação de alelos, especialmente em eletroforese de gel de poliacrilamida.", publisher = {Universidade Federal Rural de Pernambuco}, scholl = {Programa de Pós-Graduação em Recursos Pesqueiros e Aquicultura}, note = {Departamento de Pesca e Aquicultura} }