TEDE Coleção:http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/70622025-09-19T16:01:46Z2025-09-19T16:01:46ZCaracterização morfoagronômica, divergência genética e estimativas de parâmetros genéticos em acessos de pimenteiras ornamentaisSILVA, Jackson dahttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/97722025-07-22T12:13:40Z2023-11-22T00:00:00ZTítulo: Caracterização morfoagronômica, divergência genética e estimativas de parâmetros genéticos em acessos de pimenteiras ornamentais
Autor: SILVA, Jackson da
Primeiro orientador: CARVALHO FILHO, José Luiz Sandes de
Abstract: Ornamental pepper plants have been gaining ground in the ornamental segment, especially in the market for plants grown in pots. However, despite its importance, the national market has few cultivars developed specifically for the ornamental segment. To develop a new cultivar, one of the steps is the characterization of accessions to identify genotypes that present desirable characteristics. Furthermore, knowledge of the genetic divergence of accessions allows breeders to use important information to obtain new cultivars. Given the above, the objective of this research was to carry out the morphoagronomic characterization, estimate the genetic diversity and genetic parameters of ornamental pepper accessions. The experiments were conducted under greenhouse conditions belonging to the Pernambuco Agronomic Institute (IPA), located in Recife. 20 accessions of ornamental pepper plants were used, belonging to the IPA Capsicum germplasm bank, they are: 403, 404, 407, 408, 410, 411, 414.1, 414.2, 416, 423, 424, 429, 431, 435, 436, 439, 442, 443, Canudos and IFV. After analysis, it was found that accessions 404, 408, 410 and 423 meet the plant height standard (ATP) recommended by the market. For the characteristics related to the color of the fruits, which attract a lot of attention from consumers, the color of the immature fruit (CIM) and the color of the mature fruit (CMD) accessions 408 and IFV presented lilac/brown/green (mixture of colors) and dark red colors, respectively, in addition to having more compact architecture. In the UPGMA method, 3 groups were formed, in which 2 groups were formed by 18 accesses. In the principal components analysis, the accumulated variance up to the seventh component reached 83.99%. The characterization of ornamental pepper accessions exposed a wide genetic variability among the accessions studied, indicating that there are promising accesses for the consumer market. The analysis of genetic divergence, considering quantitative and qualitative characteristics, quantified the genetic distances between groups, possible crosses for the development of new cultivars are being observed.
Instituição: Universidade Federal Rural de Pernambuco
Tipo do documento: Tese2023-11-22T00:00:00ZSeleção massal estratificada como estratégia de melhoramento em coentro para tolerância à salinidade e à acidez da solução nutritivaROCHA, Fernando Antônio Tenóriohttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/95062024-02-19T13:40:01Z2021-02-18T00:00:00ZTítulo: Seleção massal estratificada como estratégia de melhoramento em coentro para tolerância à salinidade e à acidez da solução nutritiva
Autor: ROCHA, Fernando Antônio Tenório
Primeiro orientador: MENEZES, Dimas
Abstract: As an olive grower widely appreciated in the North and Northeast of Brazil, coriander is grown in environments subject to salinization and acidification. In this context, the development of cultivars tolerant to these abiotic stresses is necessary. This work aims to obtain populations of Coriander Verdão tolerant to salinity and acidity, using stratified mass selection as an improvement method. One polycross was carried out between plants from 5 seed producing companies to obtain the base population and 4 cycles under saline stress with electrical conductivity 8.0 dS.m1 and 3 cycles under acid stress with pH 4.0. The characteristics evaluated were height and number of leaves at 14, 21, 28 and 35 days after planting and fresh mass of the aerial part, dry mass of the aerial part, fresh mass of the roots, dry mass of the roots, length of the roots, rate of accumulated growth and succulence of the aerial part at 35 days after planting, at the time of harvest. All cultivations were carried out in a greenhouse, in hydroponics with substrate. For the salinity experiment, significant differences were found for the source of variation, planting time and salinity, but there was no significant difference for source populations and for interactions between sources. For the acidity experiment it was found that there was a significant difference for planting time and between few characteristics for populations. There were also no significant differences for the interactions between the sources. The absence of interactions shows that the factors are independent, and the improvement can be practiced at any time of planting. Although there was no effective result for the selection, important information was found, such as the possibility of growing Verdão coriander in a nutrient solution with an electrical conductivity of 8.0 dS.m-1 with reduced production and at a satisfactory pH 4.0. It was also identified that the cultivation of Coriander Verdão in a greenhouse under saline stress and acidity is affected by environmental conditions.
Instituição: Universidade Federal Rural de Pernambuco
Tipo do documento: Tese2021-02-18T00:00:00ZGenômica comparativa e filogenia de espécies de fitonematóides e reação de genótipos de Psidium spp ao parasitismo de Meloidogyne enterolobiiROSSITER, Jackeline Gadé de Araujohttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/95052024-02-16T18:42:18Z2019-05-21T00:00:00ZTítulo: Genômica comparativa e filogenia de espécies de fitonematóides e reação de genótipos de Psidium spp ao parasitismo de Meloidogyne enterolobii
Autor: ROSSITER, Jackeline Gadé de Araujo
Primeiro orientador: MARTINS, Luiza Suely Semen
Abstract: The main phytosanitary problem of the guava crop in our country is meloidoginose, caused by Meloidogine enterolobii Yang and Eisenback (= M. mayaguensis. Its incidence results in a marked drop in productivity and, in most cases, the death of plants in medium-term. In general, the best chances of success in the control of M. enterolobii are in the use of resistant materials, which can be obtained by genetic improvement. Several studies have already been carried out on the resistance of guava tree and araçá tree about this pathogen, in which a wide range of methods and criteria were used to classify the genotypes. However, up to the present no guava genotypes resistant to M.
enterolobii have been found. In order to control the nematode in question, the objective of this research was to contribute to identify sources of resistance in guava Psidium guajava L., Psidium sp. and other species of the family Myrtaceae. The three scientific articles that compose this PhD thesis in the Graduate Program in Agronomy - Genetic Improvement of Plants, at UFRPE, they were developed with the intention of contributing to the identification of resistance sources in species of Myrtaceae that may serve in the future as rootstock for commercial guavas. The first article had as objective to evaluate different levels of inoculum of M. enterolobii, times of evaluation and to compare two levels of substrates, in screenings of Psidium spp. The evaluations occurred at 30 (E1), 60 (E2), 90 (E3), 120 (E4) and 150 (E5) days after inoculation, in two containers with different volumes (R1 and R2), four levels of inoculum I1, I2, I3 and I4) with six replicates. Each experimental plot consisted of one plant, totaling 240 plots which were delineated in DIC (completely randomized). According to the results obtained, it was concluded that the evaluation of parasitism tests of Meloidogyne enterolobii in Psidium spp can be carried out using a smaller number of inoculum (2000 eggs / plant) in a period of only three months, thus streamlining the results of the research with this pathogen. The second article had the following objectives: (1) To observe the organization and conservation of mitochondrial genomes of phytonematous species deposited in public databases; and (2) To carry out phylogenetic analyzes among species of phytonematodes based on sequences of mitochondrial genes (Cox1) and nuclear genes (rRNA 28s). it was concluded that the phylogenetic trees of the phytonematoid species showed consistency with the classification proposal at the family level. Based on the results of the phylogenetic analyzes, the inclusion of the species in the family Pratylenchidae or removal of species of the genus Radopholus and inclusion of these species in the family Hoplolaimidae is recommended. It is clearly observed the paraphyletic inside the genus Heterodera, which the markers used may not have sufficient resolution to base the classification of this group. The third article had as objective to evaluate the genotype response of the species Psidium guineense and Eugenia uniflora to the nematode parasitism M. enterolobii. At the end of the evaluation, one P. guineense genotype and all 10 E. uniflora genotypes showed resistance to the pathogen. This opens the possibility for its use as rootstock for commercial varieties or cultivation in infested areas for the reduction of the nematode population in the soil.
Instituição: Universidade Federal Rural de Pernambuco
Tipo do documento: Tese2019-05-21T00:00:00ZFilogenia molecular e análise in silico do inibidor de protease Bowman-Birk de espécies da subfamília PapilionoideaeSILVA, Flávia Gomes dahttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/95042024-02-16T18:32:23Z2023-01-31T00:00:00ZTítulo: Filogenia molecular e análise in silico do inibidor de protease Bowman-Birk de espécies da subfamília Papilionoideae
Autor: SILVA, Flávia Gomes da
Primeiro orientador: SILVA, Gheysa Coelho
Abstract: Fabaceae (Leguminosae) é a terceira maior família de dicotiledôneas. Subdividida em seis subfamílias, constitui a terceira maior família de angiospermas, ficando atrás de Asteraceae e Orchidaceae. Dentre essas subfamílias Papilionoideae se destaca por representar dois terços de todos os gêneros e espécies da família, com aproximadamente 14.000 espécies, 501 gêneros e 32 tribos. Essa subfamília é reconhecida por sua grande importância alimentar, forrageira e biológica, com ampla distribuição nos diversos tipos de biomas. Nesta subfamília também é relatado na literatura a existência do inibidor de protease do tipo Bowman-Birk (BBI) em diversos representantes de Papilionoideae, sendo reconhecido por sua ação inseticida, dentre outras funções importantes nas plantas. Com o surgimento de novas tecnologias de sequenciamento de DNA, bem como os avanços das ferramentas de bioinformática, favoreceu a utilização de inúmeras formas de estabelecer correlações evolutivas entre as espécies desta subfamília. Atualmente, em razão da baixa taxa mutacional dos genomas de cloroplasto (cpDNA), as análises filogenéticas baseadas em cpDNA, tem resolvido as relações entre os principais táxons de Papilionoideae. Nesse sentido, os transcritos de proteínas importantes também podem ser ferramentas para estabelecer correlações entre espécies, uma vez que partem do mesmo princípio de baixa taxa de mutação, bem como identificar, caracterizar e predizer domínios funcionais de proteínas por meio da abordagem in sílico. Com o objetivo de realizar uma reconstrução filogenética de espécies da subfamília Papilionoideae baseada em seis genes plastidiais, foram obtidas sequências completas dos plastomas de espécies da subfamília Papilionoideae e dos genes isolados do banco de dados GenBank. O alinhamento das sequências foram realizadas e a reconstrução filogenética foram realizadas com uso do software MEGA 7. Para reconstrução filogenética foi utilizado o método de Máxima Verossimilhança com suporte estatístico calculado pelo método de bootstrap (BS), com 1000 replicatas. As correlações filogenéticas para subfamília Papilionoideae resultaram em uma árvore monofilética, confirmando a divisão da subfamília em quatro principais clados, NPAAA, ADA, Genistoides e Dalbergioides. O clado ADA foi relacionado como grupo irmão do clado Genistoides, com alto suporte. Foi evidenciado o parafiletismo das tribos Phaseoleae e Millettiae, dentro do clado NPAAA. Também observamos, que apenas as espécies do clado ADA não possuem nódulos rizobianos, o que pode configurar uma possível sinapomorfia para sustentar as relações desse grupo. Da mesma forma, a análise do tempo de divergência sugere que os principais clados de Papilionoideae divergiram a partir do Paleoceno. As sequências da BBI foram recuperadas do banco de dados GenBank, por meio da ferramenta BlastP. Os parâmetros físico-químicos foram avaliados através da ferramenta ProtParam. A identificação de domínios funcionais foi avaliada por meio do servidor Prodom e a estimativa de efeitos mutacionais foi feita por meio do servidor SNAP2. O alinhamento de sequência das proteínas foi realizado por meio do algoritmo ClustalW e a árvore filogenética produzida no software MEGA 7, pelo método de Máxima Verossimilhança. O servidor GalaxyTBM foi utilizado para predição de estrutura das proteínas em modelos 3D. Os resultados obtidos entre as sequências de BBI revelaram dois domínios funcionais, caráter hidrofílico e ponto isoelétrico ligeiramente ácido para todas as espécies analisadas. A análise de agrupamento por Máxima Verossimilhança das espécies da tribo Phaseolea (Papilionoideae) construídas por meio das sequências da proteína BBI, apresentam consistência com a classificação mais recentes para as espécies analisadas. A partir do gráfico de Ramachandran, foi possível verificar que os modelos 3D gerados, evidenciaram excelente qualidade estereoquímica e boa qualidade estrutural. Estas informações em conjunto, podem auxiliar os programas de melhoramento genético dessas culturas, por meio de métodos convencionais ou engenharia genética.
Instituição: Universidade Federal Rural de Pernambuco
Tipo do documento: Tese2023-01-31T00:00:00Z